Với 1.549 ha rừng tự nhiên và 6.716 ha mặt nước, Cù Lao Chàm mang trong mình một sự đa dạng sinh học vô cùng phong phú. Hệ thực vật trong những cánh rừng ở Cù lao Chàm có hơn 500 loài với nhiều loại lâm sản quý như gõ, kiền kiền, dẻ, chua, mây... Có khoảng 228 loài cây làm thuốc, nhiều loại dược liệu quý như mã tiền, sơn máu, ngũ gia bì. Đặc biệt là 2 loài cây thuốc Nam quý hiếm nằm trong sách đỏ Việt Nam là cây Cỏ nhung và Trầm hương. Hệ động vật có 12 loài thú, 13 loài chim, 130 loài bò sát, trong đó có Khỉ đuôi dài và Chim yến. Cù lao Chàm còn nổi tiếng với 135 loài san hô thuộc 35 giống, có 6 loài được ghi nhận đầu tiên ở nước ta. Hệ sinh vật biển còn có các loại hải sản quý như tôm hùm, ốc hương, ngọc trai, đồi mồi, ốc vú nàng, cua đá…

Đến đây, du khách có thể ghé bãi Làng (bãi chính của Cù lao Chàm) với vịnh biển đẹp, nhấp nhô tàu thuyền lớn nhỏ cùng ngư dân thân thiện. Đặc biệt bãi Làng chiếm phần lớn là rừng nguyên sinh điệp trùng ngút tầm mắt dọi xuống đến biển xanh.

Qua bãi Làng đến bãi Ông, bãi Chồng, bãi Hương.. là những dãy bờ biển cát trắng và biển trong xanh đến nhìn rõ đáy cát. Sóng nhỏ và biển nông, du khách thỏa thích đắm mình thư thái hoặc dạo thuyền máy tham quan trên biển quanh các hòn đảo.

Đến Cù Lao Chàm, du khách cũng không nên bỏ qua cảnh chim Yến bay vào các hang để làm tổ, cung cấp món thực phẩm cao cấp, bổ dưỡng. Hang Yến tập trung nhiều nhất ở các vách đá thẳng đứng ở Hòn Lao.

Cù Lao Chàm từng là nơi dừng chân của các thương thuyền Trung Quốc, Nhật, phương Tây trước khi đến thương cảng Hội An làm ăn cách đây hơn 150 năm. Từ khi Hội An được công nhận di sản văn hóa thế giới cách đây 10 năm, du khách đến Hội An đều dành thêm ngày du lịch để ra đảo Cù Lao Chàm.

Vào mùa du lịch, từ tháng 3-9, mỗi ngày có vài trăm du khách ra hòn đảo xinh đẹp này. Ngoài cảnh vật được thiên nhiên ban tặng, người dân cù lao rất thân thiện, chân tình, và hết sức có ý thức gìn giữ môi trường. Họ chắt chiu khi vứt xả rác xuống biển, họ ngại ngùng khi dong lưới đánh bắt hải sản cấm, giữ rừng xanh như bếp của mình… Chính quyền Cù lao Chàm đang áp dụng chính sách không sử dụng túi nilông, không xả rác để bảo vệ môi trường biển thân yêu của quê hương.